Tim gaat op zoek naar zijn vader en ontmoet een pratende Pikachu. Deze Pikachu is een harde detective die houdt van koffie. Samen lossen ze mysterieuze zaken op. Ze praten met getuigen en verzamelen aanwijzingen. Pikachu kan ook informatie vergaren bij andere Pokémon. Tijdens hun onderzoek komen ze op een groter mysterie dat vreemde dingen doet met Pokémon.