Onimusha 2: Samurai's Destiny is een verbeterde versie van het originele spel met HD-graphics en verbeterde besturing. Je speelt als Jubei Yagyu en vecht je weg door feodale Japan. Het spel heeft extra taalondersteuning.
Er zijn nieuwe functies zoals een galeriemodus met schetsen van de personageontwerper, een digitale soundtrackselectie, een Hell-modus voor extra uitdaging, en minigames die vanaf het begin beschikbaar zijn. Ook is er een functie voor automatisch opslaan en eenvoudig wisselen van wapens.
Als je Onimusha: Warlords op Steam hebt, kun je een speciale outfit voor Jubei ontgrendelen. Deze outfit verandert alleen het uiterlijk, niet je status in de game.