De DS-versie van Pro Evolution Soccer 2008 biedt gameplay dat sterk lijkt op de andere versies. Schieten, passen en steekpasses werken op dezelfde manier. Het kleinere scherm van de DS wordt gecompenseerd door een radar op het onderste scherm.
Voor de besturing gebruik je voornamelijk de knoppen van de DS. Het touchscreen komt alleen in beeld bij de replay-optie. Met de stylus kun je de camera draaien tijdens herhalingen.