Sam Fisher wordt uit zijn pensioen gehaald door Third Echelon, een geheime Amerikaanse groep. Hun doel is een nieuwe dictator te stoppen die de wereld bedreigt met technoterrorisme. In Splinter Cell, een spel dat zich in de nabije toekomst afspeelt, neem je de rol van Sam aan. Hij is een getrainde scherpschutter met toegang tot ultramoderne wapens.
Het spel is niet alleen over schieten. Als eenzame agent moet je vaak achter vijandelijke linies opereren. Je moet je sluipvaardigheden gebruiken om missies uit te voeren. Dit betekent dat je je in de schaduwen verbergt, lampen kapot schiet en Sams nachtzichtkijker gebruikt om je weg te vinden.