Towa and the Guardians of the Sacred Tree is een Roguelite-aventuur waar je Towa en haar bondgenoten helpt in hun strijd tegen de demon Magatsu. Je verkenst een wereld vol gevaren en wonderen, met mysterieuze landschappen en betoverende muziek. Als priesteres van Shinju bundelt Towa haar krachten met acht trouwe bondgenoten om Magatsu te verslaan. Je kiest een duo uit negen personages, elk met unieke vaardigheden. Samen vecht je je door de kleurrijke contreien en verslaat je de dienaren van Magatsu.
Terwijl je expedities uitvoert, evolueert het dorp Shinju. Je smedt banden met de inwoners, ontdekt hun verhalen en verbetert je vaardigheden in de dojo. In de smederij maak je nieuwe zwaarden en ontvang je krachtige gaven.