World of Final Fantasy is een avontuur voor twee broers en zussen die hun verloren herinneringen terug willen vinden. Ze reizen naar een vreemd land waar alles op elkaar gestapeld is en ontmoeten nieuwe vrienden en bekende Final Fantasy-helden. Het verhaal draait om het ontrafelen van hun verleden.
Het spel introduceert een nieuw gevechtssysteem waar je monsters kunt vangen en gebruiken om torens te bouwen. Je kunt de grootte, elementen en volgorde van de monsters aanpassen om effectiever te vechten. Monsters kunnen worden aangepast, geleveld en ontwikkeld om nieuwe vaardigheden te verkrijgen. Je kunt ze ook berijden om sneller door de wereld te reizen.
De wereld is verticaal gestapeld, wat betekent dat je door dungeons kunt klimmen en obstakels moet overwinnen met behulp van monstervaardigheden en magicite-effecten.