In 9 Clues: The Secret of Serpent Creek volg je een privédetective met bijzondere gaven die een noodkreet krijgt van haar vriendin Helen, een journaliste. Helen verdwijnt spoorloos na een onderzoek in Serpent Creek, een stad waar de inwoners zich vreemd passief gedragen en de straten krioelen van slangen.
De detective arriveert te laat maar ontdekt dat de stad schuilgaat voor een kwaadaardig complot: de wederopstanding van de Slangengod. Jij speelt mee als detective en moet Helen redden, de verborgen waarheden achter de inwoners blootleggen en een duister mysterie oplossen.
Het verhaal draait om een mysterieus misdaadverhaal met onverwachte wendingen en minigames die je verder helpen. Daarnaast is er een Detective-modus om aanknopingspunten vast te leggen en een logboek bij te houden. Het spel is volledig in het Nederlands.