In Yakuza 6: The Song of Life keert Kiryu terug en ontdekt hij wat mensen bereid zijn te doen voor de mensen van wie ze houden – of die nu familie zijn of niet. Na drie jaar gevangenisstraf komt hij erachter dat Haruka, zijn surrogaatdochter, verdwenen is uit het weeshuis dat hij beschermt. Het spoor leidt naar Kamurocho, waar hij ontdekt dat ze is aangereden en nu in coma ligt.
Met Haruka’s zoontje in zijn armen reist Kiryu naar Onomichi, een havenstad in Hiroshima, om de waarheid te achterhalen. Daar stuit hij op een duister geheim dat de lokale yakuza beschermt. Je speelt een mix van harde actie, diepgaande verhalen en levendige omgevingen, van de drukke straten van Kamurocho tot de serene havens van Onomichi.