In Blackwind speel je James Hawkins, een tiener die vast komt te zitten in een prototype van een gevechtspak, een Battle Frame. Dit pantser moet je helpen om een alieninvasie op planeet Medusa-42 te overleven. De planeet wordt aangevallen door de Raknos-horden, die elke menselijke kolonie vernietigen, dus tijd is kostbaar.
Je moet vijanden uitschakelen, het pantser leren bedienen en je vermiste vader opsporen voordat het te laat is. Maar James is niet alleen: er schuilt een onverwachte bondgenoot in zijn Battle Frame die hem bijstaat in de strijd.