Football Manager 2006 op de PSP is een verbeterde versie van Football Manager 2005, met eenzelfde engine maar meer opties. De ontwikkelaars hebben goed geluisterd naar de wensen van de fanbase, waardoor onderhandelingen nu verder gaan dan alleen contractduur en salaris.
Je krijgt nu invloed op het transferbudget, de salariskosten en andere financiële aspecten. Daarnaast kun je je team in de rust toespreken, zowel collectief als per speler. Het man-management gaat dieper in op individuele problemen en biedt tools om die op te lossen.