Inazuma Eleven GO: Stones, Thunderflash is een voetbal-RPG voor de 2DS en 3DS. Je speelt als Arion Sherwind en reist met Fei Rune door de tijd om de Ultimate Eleven te vinden en het voetbal weer normaal te maken.
Tegenstanders worden verslagen met nieuwe moves, 'armourfy'-mogelijkheden voor Fighting Spirits en het combineren van aura’s van je spelers. De game introduceert een vierde dimensie in het voetbal met unieke tactieken en upgrades.