In Poképark Wii: Pikachu's Adventure bescherm je de Poképark tegen gevaren. Je verzamelt deeltjes van het kostbare Sky Prism, maar die liggen verspreid over verschillende gebieden. Om ze te pakken, moet je lastige opdrachten vervullen.
Het avontuur begint als Pikachu en zijn vrienden een mysterieuze tunnel ingaan. Die leidt naar de Poképark, met stranden, sneeuwlandschappen, mijnen en talloze spellen.
Je bestuurt Pikachu en reist door verschillende gebieden. Onderweg ontmoet je andere Pokémon en krijg je opdrachten, zoals Skill Games. Die variëren van verstoppertje tot Pokémon-gevechten. Als je wint, kun je vriendschap sluiten met de Pokémon die je de opdracht gaf.