Speel je in de rol van een Navy SEAL-commandant met SOCOM 3: US Navy Seals voor de PS2. Je leidt een team van specialisten en moet 14 missies volbrengen achter vijandelijke linies. De missies hebben uitgebreide plots en wisselende doelen, waardoor elke situatie uniek wordt.
Je kunt kiezen uit meer dan 40 wapens en uitrustingen om je team aan te passen aan de taak. Het Command Equity System beloont je voor het behalen van hoofddoelen, terwijl Local Influence extra punten geeft als je de lokale bevolking helpt en burgerslachtoffers minimaliseert.