Star Wars: Lethal Alliance is een avontuur dat zich afspeelt tussen Episode III: Revenge of the Sith en Episode IV: A New Hope. Je speelt als de Twi'lek Rianna Saren en haar veiligheidsrobot Zeeo. Samen wordt je door de Rebel Alliance ingehuurd om de planeten van de Imperial te infiltreren en het op te nemen tegen deze vijandelijke krachten.
Je doel is het blootleggen van het gevaarlijkste geheim van het Empire: de Death Star. Door de wapen- en acrobatische vaardigheden van Rianna te combineren met de multifunctionele verdedigingssupport van Zeeo kun je een sterk team vormen. Alleen door samen te werken kun je je missies voltooien.
Je moet holografische vermommingen gebruiken om bewakers van de Imperial om de tuin te leiden. Tijdens je avontuur kom je op veel bekende locaties zoals Tatooine, Despayre, Danuta, Alderaan, Coruscant en Mos Eisley. Hier zul je veel bekende karakters en rassen uit het Star Wars universum ontmoeten, waaronder Boba Fett, Kyle Katarn, prinses Leia Organa, Darth Vader, Rodians, Quarren en vele stormtroopers.