De actievolle avontuur van Syphon Filter: Logan's Shadow neemt je mee in een spannend verhaal geschreven door Greg Rucka, bekend van onder meer Queen and Country en Batman. Gabe Logan keert terug en moet een gevaarlijke nieuwe technologie terugvinden die in handen is gevallen van een criminele extremistengroep.
De missies voeren hem van de Indische Oceaan naar woestijnen in het Midden-Oosten, waarbij hij zelfs moet afvragen of zijn oude partner Lian Xing wel betrouwbaar is. Het spel combineert stealth met actiegedreven gameplay en introduceert nieuwe mechanieken zoals blindvuur om vijanden dekking te laten zoeken, een verbeterd gevechtssysteem met mogelijkheid om vijanden als menselijk schild te gebruiken, en 360-graden onderwatergevechten.
Voor het eerst zijn er interactieve momenten toegevoegd, zoals het verplaatsen van puin of ontsnappen uit handboeien. De Havok physics engine zorgt voor realistische fysica in zowel personages als omgevingen. Nieuwe wapens zoals granaatwerpers, kleefmijnen, rookgranaten en flitsgranaten, alsook verbeterde bondgenotenmissies met nieuwe opdrachten, maken het spel compleet.
Nieuw in deze editie: onderwatersystemen met een speerpistool en boltpistool, en een soundtrack van Azam Ali. De game biedt zowel single- als multiplayeropties met verbeterde buddymechanieken.