In The Legend of Zelda: Twilight Princess moet je als Link, een boerenjongen, het land Hyrule redden van een kwaadaardige duisternis. Wanneer je de Twilight Realm betreedt, verandert Link in een wolf en krijgt je hulp van het mysterieus meisje Midna.
Met de Wii-afstandsbediening kun je precies richten en besturen. Je verkent het enorme landschap van Hyrule, lost puzzels op en vecht door gevaarlijke kerkers. In de Twilight Realm gebruik je je krachten als wolf en Midna's magie om licht te brengen.
Naast je zwaard en schild kun je ook je boog gebruiken, van paarden vechten en andere voorwerpen inzetten. Met de Wii-afstandsbediening kun je bijvoorbeeld vissen of een spin-aanval uitvoeren met de Nunchuk.