In Watch Dogs draait alles om het Central Operating System (ctOS), een digitaal netwerk dat steden controleert en verbonden is met persoonlijke data van inwoners. Je neemt de rol aan van Aiden Pearce, een getalenteerde hacker met een duister verleden in de criminele wereld.
Na een tragische gebeurtenis in je familie ga je op zoek naar de verantwoordelijke. Daarbij gebruik je je hackerskills om ctOS te misbruiken. Je kunt beveiligingscamera’s hacken, persoonlijke informatie opvragen, verkeerslichten en openbaar vervoer manipuleren – en nog veel meer. Alles om je doel te bereiken en je vijanden te stoppen.