Monster Hunter 3 Ultimate maakt gebruik van de unieke functies van Wii U en Nintendo 3DS om een intuïtieve jachtsimulatie te bieden. Met de Target Camera-functie kun je met een druk op de L-knop snel op nabije monsters focussen. De touchscreenfuncties van beide systemen geven je snelle toegang tot boeken, wapens, plattegronden en minigames.
De hoogkwalitatieve beelden van de Wii U en de 3D-beelden van de Nintendo 3DS zorgen voor een rijke spelervaring. Je kunt de wereld van Monster Hunter alleen of met twee tot vier spelers verkennen, afhankelijk van je platform. Met de zoekfunctie van de Nintendo 3DS kun je makkelijk andere jagers in je omgeving vinden.
Spelers met een Wii U kunnen online jachtgroepen van maximaal vier spelers vormen of via draadloze communicatie samenspelen met Nintendo 3DS-spelers. Als je beide versies van het spel hebt, kun je je opgeslagen gegevens tussen de twee systemen overzetten, zodat je zowel thuis op tv als buitenshuis op jacht kunt gaan.