In Ninja Gaiden II speel je als Ryu Hayabusa, een ninja die zijn clan wreekt en het menselijk ras beschermt tegen vernietiging. Het verhaal draait om wraak en vriendschap, met dramatische gebeurtenissen die je langs Tokio, New York en de onderwereld leiden.
Je hebt toegang tot een breed scala aan wapens en Obliteration Techniques, waarmee je vijanden snel en stijlvol uitschakelt. Naast Ryu gebruiken ook zijn vijanden acrobatische vechtbewegingen en aanvalstechnieken. Het spel biedt verschillende moeilijkheidsniveaus, van beginner tot expert, en een nieuw gezondheidssysteem dat een deel van je levensbalk automatisch aanvult na het opslaan.
Met de Ninja Cinema-optie kun je je eigen gameplay opnemen, bewerken met een zwart-witfilter en delen via Xbox Live. Zo maak je traditionele Japanse samurai-filmpjes van je avonturen.