In Black Angel speel je als kunstmatige intelligentie die een bemanning van robots bestuurt op een missie van millennia lang: het veiligstellen van het genetische erfgoed van de mensheid en het transporteren naar een nieuwe bewoonbare planeet, Spes. De aarde is onbewoonbaar geworden en de grootste landen hebben samengewerkt om het grootste ruimteschip ooit te bouwen, de Black Angel.
Jouw taak is om met de robots en middelen onder jouw controle de planeet te bereiken, te vechten tegen de Ravagers, nieuwe technologieën te ontdekken via contact met buitenaardse beschavingen en de ruimte te verkennen. De AI met de hoogste score mag uiteindelijk toezien op het herontwaken van de mensheid op Spes.