Bionicle Heroes is een actiegame gebaseerd op het bekende Bionicle-universum van LEGO. Je speelt als Toa Inika, een held uit de goede kant, en vecht tegen de vijandige Piraka op het eiland Voya Nui. Het doel is om de Mask of Life te vinden en deze te gebruiken om de wereld te redden.
De game draait niet alleen om vechten, maar ook om het verzamelen van maskers. Deze maskers geven je unieke krachten, zoals lopen over water of muren verslepen. Daarnaast kun je verschillende wapens gebruiken, elk met eigen functies en upgrades. Zo kun je een geweer besturen dat de grond doet trillen of transformeert in een zwaard als het oververhit raakt. Sommige wapens hebben zelfs meerdere upgrades, zoals een optie om automatisch op tegenstanders te locken of sneller te schieten.
De levels spelen zich af in uiteenlopende werelden, waaronder vuur-, ijs- en tropische omgevingen. De Nintendo DS-versie gebruikt de unieke besturing van de console, waarbij je alles bedient met de stylus en wapens wisselt via het onderste scherm.